藏君洞為一大型天然溶洞，溶洞長25000米，已探明洞長4000m，洞內洞中有洞、洞中有河，迂回曲折，地下河流水潺潺，溶洞分布在石炭系中、上統(tǒng)碳酸鹽巖中，洞內鐘乳石十分豐富：石筍、石柱、石幔、石樓、石像比比皆是。洞內構造奇特，石鐘乳千姿百態(tài)、絢麗多彩，景觀奇秀，珍品奇絕，是我國少有的大型碳酸鹽巖巖溶洞穴之一。目前已開發(fā)的4000m洞穴中，由十二個大的溶洞群構成，由洞口往里有護君堂、惠帝殿、兩重天、南巡廳、不夜城、龍鳳宮、北國廳、江南廳、江河壩、閱兵場、國寶廳等溶洞景觀區(qū)。溶洞一般高5～30m，長60～100m，寬10～20m，面積60～200㎡。十二個溶洞沿地下河呈串球狀分布，洞與洞之間有巷道（地下河管道）相連，溶洞中景觀十分豐富，仿佛是一個瑰麗的地下宮殿。如護君堂內有“尚書帽”、“御馬”、“貓頭鷹”、“小羊羔”、“老夫妻”、“天宮浴盆”等景點，惠帝殿內由“斷劍石”、“龍椅”、“觀音立佛”、“觀音蓮花寶座”等，“蔬果長廊”中有形似花菜、白菜、絲瓜、茄子、黃瓜等石筍，不夜城內有乳白色石鐘乳巖溶坡面，龍鳳宮內有石幔、石柱琳瑯滿目及鐘乳石構成的似漢白玉“龍鳳石床”、“旭日東升”的浮雕石鐘乳墻、“燈籠群”、“攀龍柱”、“石蓮花”等，國寶廳巨型石柱等，巷道側壁唐僧師徒“西天取經(jīng)”壁畫等，景觀類型齊全，是巖溶洞穴中具有典型地學意義的巖溶地貌景觀，屬國家級的地質遺跡景觀。
此洞的形成與區(qū)內構造關系密切。藏君洞與蓮花涌泉一道屬同一背斜與斷裂控制，即區(qū)域蔡家邊－江塘背斜轉折部位之西及古塘坪－觀音洞壓性斷裂帶中段之西側，沿斷裂帶西側節(jié)理及層間裂隙發(fā)育。地下河的延伸基本沿斷裂帶，而溶洞發(fā)育多于層間裂隙和北東向構造裂隙關系密切。藏君洞地下水流量平均達88 L/S，而地表有巖溶洼地2個，地表水與地下河貫通，使地下河終年流水不斷，因而對地下水管道周圍碳酸鹽巖巖溶作用不斷加強，經(jīng)過漫長的地史時期，形成現(xiàn)在的這個大溶洞。
